构建一个能够处理两千万条记录的查询系统需要考虑的因素有很多，包括数据存储、索引设计、查询优化等。下面是一个基本的设计思路：

1. 数据存储：可以选择关系型数据库（如MySQL, PostgreSQL）或者非关系型数据库（如MongoDB）。对于大数据量的情况，可以考虑使用分布式数据库（如Cassandra, Hadoop）。

2. 索引设计：为了提高查询速度，需要为经常查询的字段创建索引。例如，如果经常根据用户ID查询用户信息，那么就应该为用户ID创建索引。

3. 查询优化：除了创建索引外，还可以通过其他方式优化查询。例如，可以使用分页查询来减少每次查询的数据量，或者使用缓存来减少对数据库的访问。

4. 分布式架构：对于如此大量的数据，可能还需要考虑使用分布式架构。例如，可以将数据分散到多个服务器上，每个服务器只负责一部分数据的存储和查询。

5. 并发控制：在高并发的情况下，需要考虑如何控制并发访问，防止出现数据不一致等问题。这可以通过事务、锁等方式实现。

6. 安全性：考虑到数据的安全性，需要设置合适的权限管理，保证只有授权的用户才能访问特定的数据。

7. 日志与监控：最后，还需要有完善的日志记录和监控机制，以便出现问题时能够及时发现并处理。

以上只是一个大概的设计思路，具体实施时还需要根据实际需求进行调整。